Серіал присвячений розкриттю злочинів, які розслідує спеціальний агент ФБР Сілі Бут за допомогою команди антропологів з Джефферсонський інституту (алюзія на Смітсонівський інститут) під керівництвом доктора Темперенс Бреннан на прізвисько «Кістки». Доктор Бреннан і її команда, як правило, отримують справи, де від тіла вбитого залишилися тільки кістки або ж розкладені залишки. Крім злочинів у серіалі також розкриваються особисті взаємини між основними персонажами, включаючи потенційний роман між Бутом і Бреннан. Літературною основою персонажів серіалу є цикл детективних романів Кеті Райкс, головною героїнею яких є доктор Бреннан. Наразі опубліковано 12 книг. Кеті Райкс є дипломованим антропологом, яка здійснювала судмедекспертизи для ФБР, і образ доктора Бреннан в книгах багато в чому є її альтер-его. Кеті Райкс також виступає продюсером даного серіалу. У серіалі Бреннан теж пише детективніромани, причому героїню її романів звуть Кеті Райкс.

У процесі розслідування вбивства детектив Кейт Бекет (Стана Катіч) помічає схожість місця злочину зі змальованими в детективах відомого письменника Річарда Касла (Натан Філліон). Касл стає підозрюваним, проте при подальшому розгляді справи він виявляється не причетним. Маючи дружні стосунки з мером та іншими впливовими людьми міста Касл напрошується бути присутнім на всіх розслідуваннях, які проводитиме детектив Бекет, доки не збере матеріал для своєї майбутньої книги.

Фелісіті Портер навчається в школі і вже цілих чотири роки їй подобається Бен, від якого вона божевільна, але за весь час навчання вона з ним навіть не розмовляла. Якось на випускному вона просить Бена підписати її щоденник. Те, що написав Бен Ковінгтон у її щоденнику, повністю змінює Фелісіті. Вона навіть відмовляється вступати до військово-медичного училища, а прямує за Беном до Нью-Йоркського університету. У цьому місті їй не пощастить знайти кохання, зате вона зможе відкрити себе.