У безодні космосу рухається зореліт. Два члени команди, що прокинулися від гіперсну, опиняються в складній ситуації: устаткування не працює, пригадати вони нічого не можуть. Яка була їх місія? Скільки часу пройшло? Де вони? Хто вони? На всі ці питання у них немає відповідей. До того ж, на кораблі виявляються чужі — кровожерливі воїни, які знищують все на своєму шляху. У космічних мандрівників дуже мало часу. Тепер для них власні життя — не найголовніше, бо лише від них двох, можливо, залежить порятунок людства. Потрібно за будь-яку ціну відновити управління кораблем, доки загадковий Пандорум не взяв владу в свої руки.

Для наших героїв настали сумні будні: Сем втратив Мікаелу, уряд випускає законодавчий акт про виселення Автоботів з Землі, а доки Мегатрон ховається після ганебної поразки Фоллена, десептікон Шокуейв, правитель Кібертрона, готується зробити візит нашій планеті із зовсім не добрими намірами. Дія завершальної частини трилогії цього разу охопить не лише Землю, але і Місяць, темна сторона якого зберігає не менш темні таємниці.