Сюжет фільму розповість про те, як Мері, дівчинка-підліток, потрапляє в світ Листяних Людей. Це істоти, схожі на людей, але дуже маленьких розмірів. Вони захищають зелений світ всієї планети. На цей раз їх викликають жучки, коли зеленим загрожує небезпека у вигляді дивних монстрів, які знищують все, що росте. Ними керує зла павучиха. Разом із зеленими лицарями, Мері повинна врятувати природу.

Покинувши чарівне місто Ріо і відправившись в ризиковану подорож в нетрі річки Амазонки заради возз'єднання сім'ї, Блу, Перлинка і троє їхніх діточок потрапляють у справжню халепу. За межами рідної стихії, на невідомій землі Голубчикові доводиться зіткнутися з найжахливішим супротивником - власним тестем, рятуючись від підступних планів помсти з боку Найджела.

Після пригод під землею пройшло сім років. Відбувся дрейф континентів. Головні герої мультфільму, відірвані від рідних, змушені використовувати айсберг в якості плоту. Вони перетинають океан і потрапляють у невідомі їм раніше землі з екзотичними тваринами і піратами, вороже налаштованими до них. Білці Скрету вдається спіймати свій жолудь, але він переміщується у нові для нього землі.