В улюбленому шкільному місці для сну Уеноями з'явився загадковий хлопчина з гітарою, що мала іржаві струни. Уенояма зголосився їх замінити і раптом той хлопчина, Мафую, просить його: "Навчи мене грати на гітарі". З того часу, Мафую всюди ходив за Уеноямою і продовжував випрошувати. Як кажуть, вода камінь точить. Але почувши спів Мафую, Уенояма вже не зміг опиратися.

Кадіс Етрама Ді Райзел поступово освоюється у новому світі та намагається не відставати від молоді. Після інциденту з надлюдьми, дітям стирають спогади та одного з колишніх лиходіїв Рай і Франкенштейн беруть на роботу охоронцем у школі. Тепер він офіційно ворог організації та вона цього так просто не залишить.

За настановою таємничого голосу під час опівнічної прогулянки 14-річна дівчинка Ай Ото підбирає яйце. Голос вмовляє її: «Якщо хочеш змінити майбутнє, потрібно лише наважитись зробити вибір. Тепер повір у себе і розбий яйце».

Один випадковий матч запалив в Хінати Шоую божевільну любов до волейболу. Хоч в його волейбольному клубі спочатку не було навіть учасників, завзятістю і стараннями Шоую зібрана команда все-ж таки прорвалася в свій перший і останній фінальний матч середньої школи. Але там вона була начисто розгромлена Тобіо Каґеямою, відомим як "Король майданчику". Поклявшись помститися, Хіната вступає в клуб волейболу в старшій школі Карасуно... і лицем до лиця стикається зі своїм ненависним ворогом Каґеямою.

Сонхо і Мьонґі не бачилися ще з часів старших класів і ось зустрілися знову на зустрічі випускників. Для Сонхо було очевидно, що Мьонґі прийшов на зустріч лише заради нього. Сонхо відверто пристає до Мьонґі, а той його й не зупиняє, незважаючи на обручку в Сонхо.

В Королівстві Сільвейр був Король Герой Інґліс, він прожив життя присвятивши себе добробуту країни та її народу, однак він вже був не молодий і помирав. На смертному одрі до нього являється богиня Алістія, у знак подяки за всі його хороші вчинки і гідно прожите життя, вона вирішила здійснити його бажання. Король побажав переродитися і прожити життя воїна мечника. Богиня здійснила його бажання, однак він народився дівчинкою. Так починаються пригоди короля Інґліса у своєму новому житті на шляху до своєї мрії.

Наота - звичайний школяр початкової школи, в якого є батько й дід, друзі й не зовсім звична подруга 17 років, яка зустрічалася з його старшим братом. Але буденність розміреного життя розриває жінка на Веспі. Ця приблуда починає свою гру, де Наоті доведеться пройти шлях пішаком, і обернутися на короля.

Японська футбольна асоціація вирішує найняти загадкового й ексцентричного тренера Джінпачі Еґо, щоб здійснити свою мрію виграти Чемпіонат світу. Вважаючи, що Японії не вистачає егоїстичного нападника, який жадає голів, Джінпачі засновує Синю в'язницю — тюремну установу, де триста талановитих нападників із середніх шкіл усієї Японії протистоять один одному. Єдиний, хто виживе там, отримає право стати нападником національної збірної.

Порушивши головну заборону Алхімії і спробувавши воскресити маму, талановиті брати Елрікі заплатили високу ціну: молодший, Альфонс, втратив тіло, і тепер його душа прикріплена до сталевих обладунків, а старший, Едвард, позбувся руки і ноги, тому йому доводиться користуватися протезами - автобронею. Завдяки виявленим здібностям Ед отримав звання державного алхіміка і, таким чином, став частиною військової машини держави. Тепер у нього є шанс повернути Алу колишнє тіло. Попереду мандри і пригоди, розгадки страшних таємниць і нескінченні битви... У порівнянні з першою екранізацією, в оновленому «Сталевому алхіміку» дизайн персонажів став більш «дорослим». У цілому це більш динамічний твір. З першої ж серії героїв кидає у вир подій: різанина в Іштварі, боротьба відступників з Армією і фюрером Бредлі, гомункули і численні «натяки» на подальший розвиток історії. Майже повністю зберігся ансамбль сейю, і залишилися колишні характерні риси героїв, але тут вже інший склад епізодів, які грають ключову роль у формуванні образів і пояснюють суть того, що відбувається. Знову серйозну атмосферу розріджують жартівливі вставки, але скоротилися світлі моменти щасливого життя, тому серіал здається більш похмурим. Більше уваги приділено другорядним і третьорядним персонажам, особливо військовим. Що стосується сюжету, то основні теми залишилися незмінними: пошуки Філософського Каменя, розплата за скоєне, політика і підступні плани загадкових ворогів.