Історія розповідає про пригоди дівчини на ім'я Нанако. Нанако — покоївка та асистентка у шпиталі-лабораторії молодого лікаря Огамі на американській секретній військовій базі. Вона настільки наївна, незграбна і так часто потрапляє в різні негаразди з биттям посуду, поломкою меблів та медичного інвентарю, що стає незрозуміло: як ця 16-річна дівчина досі не втратила роботу? Невже тільки завдяки своїм приголомшливим формам? Але відповідь на це питання лежить набагато глибше, і знає його лише доктор Огамі...

Фантастичне аніме про нову расу наділених надприродними здібностями мутантів — діклоніусів. Аніме відрізняються жорстокістю та кривавістю. Також там є еччі (еротичні сцени). З іншого боку для Ельфійської пісні характерним є напівмелодраматичний сюжет. Твір можна доволі точно охарактеризувати як «суміш вкрай кривавого трешу з вкрай сопливою мелодрамою». Подібне поєднання страшного та милого, жорстокості та ніжності справляє сильне враження, завдяки якому Ельфійська пісня має як палких прихильників, так і ненависників.

Такаміне Юуто — звичайний хлопець із великою відповідальністю. Втративши батьків, він вирішує жити самостійно і забезпечувати свою зведену сестру Каорі. Їх спільне життя важке, але приємне; пройшов у дружніх сварках зі своїм суперником Шуном і в супроводі їхньої подруги дитинства Кьоко. Але колесо долі рухається, як хоче. Завдяки дивовижному повороту подій Юуто та його сестру викликають до іншого виміру: країни Фантасмагорії. Каорі утримується в полоні, і Юуто, не маючи можливості розуміти чи спілкуватися в цьому новому світі, змушений стати прибульцем — воїном сили — і взяти в руки меч, ставши силою конфлікту, що вирує в цьому чужому світі. Щоб захистити Каорі, неохочий Юуто кидається в бійку. Але коли він бореться разом з бійцями, відомими як Духи, що живуть серед людей Фантасмагорії, він повільно відкриває інші причини своєї постійної боротьби...

Події D.Gray-man розгортаються в Європі 19 століття і розповідають про Тисячолітнього Графа, що будує плани зі знищення світу за допомогою створених ним Акума (демонів) - людиноподібних істот, що являють собою живі знаряддя зла і поєднують у собі душу померлої людини та механічне тіло. Борються з цим Графом екзорцисти, що входять до складу Темної Релігійної Організації (Чорного Ордена). Екзорцисти - це особливі люди, наділені зв'язком з Чистою Силою, божественною субстанцією, створеною багато століть назад для того, щоб боротися із створіннями Графа. Відомо, що Чиста Сила у вигляді 109 частин розкидана по світу. Як тільки частини Чистої Сили почнуть взаємодіяти з відповідною людиною, вона перетворюється на зброю для боротьби з Акума. Головною ж метою Тисячолітнього Графа є пошуки так званого Серця Чистої Сили. Це особлива форма Чистої Сили, яка забезпечує існування всіх інших 109 частин. Знищення Серця призведе до знищення решти частин. За цим Серцем полює Граф і сім'я Ноя.